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Jueves, 17 de enero de 2013   |  Número 14 Año I
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INVESTIGACIÓN + DESARROLLO
PARTICIPA EN UN PROYECTO INTERNACIONAL CON OTROS 53 GRUPOS
Un equipo catalán, cuarto del mundo en predecir enfermedad con datos del genoma
Sus resultados en una competición reciente se publican en una revista científica

Javier Barbado. Madrid

 El bioestadístico David Rossell.

Un equipo de estadísticos e informáticos del Instituto de Investigación Biomédica (IRB) de Barcelona y la empresa Anaxomics Biotech, ha obtenido la cuarta posición mundial en la competición “Diagnosis Signature Challenge”, que forma parte del proyecto internacional Improver y en la que han participado otros 53 grupos de científicos europeos y de Estados Unidos. El reto ha consistido en proporcionar datos de expresión génica de pacientes con enfermedad diagnosticada a los participantes, que ignoraban el padecimiento identificado en cada enfermo y hubieron de averiguarlo a partir de aquella información, para lo cual se valieron de modelos bioestadísticos y correlaciones algorítmicas integradas en programas informáticos, según ha explicado a Redacción Médica el responsable de la Plataforma de Bioestadística y Bioinformática del IRB Barcelona, David Rossell.

Dos compañías, IBM Research y Philips Morris International, desarrollan el citado proyecto,  que incluye este desafío planteado a los equipos de investigación. Se trata de una primera actividad de campo cuya finalidad reside en demostrar la posibilidad del diagnóstico médico a partir de la información genética, que constituye la base teórica de la Medicina personalizada. En concreto, tras el verano de 2012 se hizo público el concurso, y los resultados se dieron a conocer a finales de año.

El grupo del IRB barcelonés ha sido coliderado por Rossell, responsable de la Plataforma de Bioestadística y Bioinformática del instituto, y Patrick Aloy, responsable de grupo en el programa conjunto IRB Barcelona-BSC de biología computacional, que está especializado en caracterizar redes moleculares para diversas enfermedades, según han explicado fuentes de la propia entidad.

De acuerdo con la explicación de Rossell a este periódico, una vez el equipo recibió muestras de pacientes con entidades nosológicas diferenciadas (en concreto psoriasis, esclerosis múltiple, enfermedad pulmonar obstructiva crónica y carcinoma de pulmón), se combinaron los datos facilitados por Aloy y sus colaboradores sobre correlación descrita en la literatura científica entre redes de genes y esas enfermedades, con algoritmos de probabilidad estadística diseñados por él mismo, y de ese modo se hizo el cálculo entregado a los organizadores de la competición y en el que los investigadores debían aclarar a qué patologías correspondía cada muestra recibida. “En la clasificación de estos resultados quedamos cuartos”, ratificó, e informó de que está prevista su publicación “en una revista científica” especializada a corto plazo.

De este modo, el proyecto “ha puesto de relieve la capacidad predictiva de la biocomputación, dado que la inmensa mayoría de los participantes ha podido diagnosticar a los pacientes con una certeza cercana al 90 por ciento, y, en algunos casos, al cien por cien”, recalcaron fuentes del IRB de Barcelona.

 

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